In einer Zeit, in der sich bereits ein Großteil der Weltwirtschaft in den Händen der zwielichtigen Kronos Organisation befindet, lebt der Profikiller Train Heartnet, wegen seiner Geschwindigkeit und einzigartigen Reflexe auch Black Cat genannt. Die Nummer XIII der Profikiller-Einheit Kronos-Numbers ist gefürchtet und skrupellos, bis er eines Tages die Kopfgeldjägerin Saya kennen lernt...