Episoden: Disc 1: Die Belagerung, Teil 3 Lieutenant Aiden Ford erholt sich nach seiner Begegnung mit einem Wraith so rasch, dass Dr. Beckett befürchtet, er könnte mit einem Wraith-Enzym infiziert sein. Alle Team-Mitglieder sind erleichtert, dass sie den ersten Angriff der Wraith auf Atlantis überlebt haben
- doch die Freude währt nur kurz, denn die Wraith bereiten schon ihre nächste Angriffswelle vor. Mc Kay entwickelt einen radikalen Plan. Aber wird die Zeit dafür noch ausreichen...? Der Eindringling Ein Mitglied der Crew wird getötet, und Mc Kay meint, eine Stromstörung sei schuld. Als ein weiteres Crewmitglied getötet wird, vermutet er jedoch faules Spiel dahinter. Ein von den Wraith kodierter Virus, der binnen kurzen die Kontrolle über die Computersysteme übernimmt, versetzt ihn in Alarmbereitschaft. Die Crew verliert zunehmend die Gewalt über die Dädalus. In einem Wettlauf gegen die Zeit versuchen sie zu verhindern, dass sich das Raumschiff gegen sie selbst.. .